ورزش سه: مربی موفق فوتبال ایران که صعود خاطره انگیز با نساجی و قهرمانی با فولاد خوزستان در جام حذفی و سوپرکاپ را در دوران کوتاه مربیگری‌اش را به نام خود کرده، در کارنامه بازی‌اش با پیراهن استقلال نیز دربی‌های هیجان انگیز و پرحاشیه‌اش را پشت سر گذاشته است. دو دربی اما با جنجال‌های زیادی نیز همراه بود.
تقابل او و رضا حقیقی پدیده تازه فوتبال ایران در اولین دربی این بازیکن یک موقعیت مناسب برای پرسپولیس شکل داد که با دخالت نکونام و بزرگنمایی حقیقی به پایان رسید. محسن قهرمانی در نزدیک‌ترین حالت به صحنه رای به ادامه بازی داد و این در حالی بود که پرسپولیسی‌ها تا هفته‌ها بعد از این بازی نیز مدعی پنالتی سوخته تیم خود بودند. حقیقی که بعد از درخشش و ملی‌پوش شدن در فجرسپاسی راهی پرسپولیس شده بود، انگیزه زیادی در تقابل با جواد نکونام باتجربه به عنوان رقیب خود در تیم ملی داشت و پس از بازی هم با لحن خاصی مصاحبه کرد و گفت "بازیکن آنها" رویش خطای پنالتی کرده است.
این اما تنها صحنه مورد بحث پرسپولیسی‌ها برای پنالتی از سوی جواد نکونام نبود. در دربی رفت همین سال و درشرایطی که هدایت پرسپولیس به مانوئل ژوزه رسیده بود، در زمان زدن کرنر، درگیری شدیدی بین محسن بنگر و جواد نکونام به عنوان شماره شش های دوتیم شکل گرفت و من تو من شدید نکونام با بنگر با سرنگون شدن مدافع پیش تاخته و بلندقامت سرخ‌ها همراه شد. داور در این صحنه نیز اعتقادی به پنالتی نداشت و این در حالی بود که بنگر با نمایش پیراهن پاره شده خود به عنوان مستندی برای این خطا، خواهان اعلام پنالتی به سود تیمش بود.
نکونام تجربه حضور در سه دربی را دارد که همه آنها با تساوی بدون گل به اتمام رسیده است.
